Аэропорт в 25 километрах о города Навои открыли в то время, когда Узбекистан был одной из Республик СССР – в 1962 году. В 1992 году, после деления Советского Союза на отдельные государства, аэропорт перешел под юрисдикцию нового правительства государства Узбекистан. В то же время была учреждена национальная авиакомпания Узбекские авиалинии.
Существенная реконструкция аэрокомплекса состоялась в 2007 году, в результате чего увеличилась пропускная способность, взлетно-посадочная полоса получила современное покрытие, выросла новая башня управления полетами.
Год 2009 для аэропорта Навои стал переломным. Его руководство было передано Корейской Авиатранспортной Компании. Корейцы взяли на себя определенные обязательства по модернизации аэрокомплекса в соответствии с 10-летним планом развития. В 2010 году уже был построен совершенно новый крупнейший в Центральной Азии терминал для грузовых авиаперевозок и другие сооружения, позволяющие существенно увеличить объем перевозимых грузов.
Базововыми в аэропорту Навои являются национальная компания «Узбекские авиалинии» и Корейская Авиатранспортная Компания.
Аэропорт Навои – современное высокотехнологичное сооружение. В аэровокзале пассажиры найдут все необходимое для того, чтобы с комфортом и интересом провести время. Здание приспособлено для людей с ограниченными возможностями. Здесь есть банки, обмен валют, кафе, ресторан национальной кухни «Солнечная долина», бар. Невдалеке от здания аэрокомплекса находится гостиница «Great Silk Road Palace», оцененная в 4 звезды, способная разместить более 100 человек. Аэропорт Навои располагает вместительным автопаркингом.
Навои расположен между двумя легендарными узбекскими городами. От Навои до Бухары 105 километров, до Самарканда – 170 километров. Три города соединяет линия скоростного поезда. На нем можно попасть из Навои в Бухару за 1 час, в Самарканд - за 2 часа.
Расстояние из аэропорта до центра Навои - 25 километров. За 25 минут туда можно добраться на маршрутном микроавтобусе. Маршрутки курсируют целый день. Такси работает круглосуточно.